Nam Đông là một huyện miền núi nằm trong vùng sốt rét lưu hành nặng và vừa; có 10 xã, 1 thị trấn với 66 thôn bản; dân số khoảng 22.573 người (2006), trong đó hơn 41 % là người Katu còn lại là người Kinh và một số dân tộc ít người khác. Sau nhiều năm thực hiện các biện pháp phòng chống tình hình sốt rét tại huyện đã có chuyển biến tốt.
Năm 2005, tỉ lệ mắc sốt rét là 1,2/1.000dân, trong đó 96,29% là bệnh nhân sốt rét ngoại lai; tỉ lệ ký sinh trùng sốt rét 0,66/1.000 dân, không có trường hợp mắc sốt rét ở đối tượng trẻ em và phụ nữ có thai, không có tử vong do sốt rét. Các chỉ số đánh giá tình hình sốt rét nói trên đều thấp hơn các chỉ số mà Dự án Quốc gia Phòng chống Sốt rét quy định (mục tiêu phòng chống sốt rét Quốc gia năm 2005: tỷ lệ mắc sốt rét 3,5/1000 dân; tử vong do sốt rét < 0,17 phần vạn).
Trước tình hình đó, năm 2006 huyện Nam đông được xây dựng và phát triển các yếu tố phòng chống sốt rét bền vững, chú trọng công tác truyền thông giáo dục, vận động nhân dân duy trì tập quán ngủ màn ban đêm. Cán bộ y tế xã, thôn bản được đào tạo và đào tạo lại để làm tốt công tác phát hiện, quản lý và điều trị các trường hợp mắc sốt rét. Biện pháp tẩm màn bằng hóa chất ICON 2,5CS tạm ngừng lại trên phạm vi toàn huyện để tiết kiệm hóa chất, kinh phí và bảo vệ môi trường. Trung tâm Phòng chống sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng tỉnh cùng với Trung tâm y tế huyện tăng cường công tác giám sát dịch tễ, giám sát hoạt động của muỗi Anopheles.
Trong 2 năm 2006-2007, đơn vị đã thực hiện 14 lượt điều tra côn trùng truyền bệnh ở 7 xã: Hương Phú, Hương Lộc, Hương Hữu, Thượng Nhật, Hương Sơn, Thượng Long và Thượng Quãng (2/3 số xã của huyện) để theo dõi mức độ phục hồi của muỗi Anopheles. Kết quả ghi nhận được thành phần loài muỗi Anopheles khá phong phú. Trước khi ngừng tẩm (2005) thu thập được 13 loài; sau khi ngừng tẩm (2006-2007) thu thập được 15-20 loài. Sau 2 năm ngừng tẩm, muỗi An. minimus - loài truyền bệnh chủ yếu đã bắt đầu phục hồi nhưng với tần suất bắt gặp còn thấp, chỉ có 16,16 - 28,57 % số lượt điều tra thu thập được muỗi An. minimus và số lượng cá thể muỗi này chỉ chiếm 0,23 % trong tổng số cá thể muỗi Anopheles; bọ gậy chiếm 3,17 - 13,79 % trong tổng số bọ gậy Anopheles bắt được. Chưa tìm thấy muỗi hoạt động đốt máu người trong và ngoài nhà, trú ẩn và tiêu máu trong nhà ban ngày. Muỗi An. minimus trưởng thành chỉ thu thập được bằng phương pháp bẩy đèn trong nhà với mật độ 0,03±0,08 con/bẩy/đêm và bọ gậy 1,29±2,23 con/100 bát múc.
Cùng với việc giám sát muỗi truyền bệnh, đơn vị đã tiến hành điều tra dịch tễ sốt rét định kỳ. Kết quả điều tra năm 2006 đã khám và thử máu cho 1810 người nhưng không phát hiện trường hợp nào mắc sốt rét lâm sàng và ký sinh trùng dương tính. Năm 2007, khám và thử máu 1888 người chỉ phát hiện được 0,05% sốt rét lâm sàng và 0,05 % nhiễm ký sinh trùng (P. vivax ngoại lai) chứng tỏ tình hình sốt rét chưa có biến động, ổn định sau 2 năm ngừng biện pháp tẩm màn.
Tháng 11/2007, Trung tâm PCSR-KST-CT đã cấp 500 màn đôi từ nguồn trung ương giúp đỡ sau lũ lụt cho huyện Nam Đông nhằm phân phối bổ sung cho đồng bào nghèo bị mất mát, hư hỏng màn không có khả năng tự mua lại để phòng tránh muỗi đốt.
Hoạt động của muỗi Anopheles và đặc biệt là mức độ phục hồi của quần thể muỗi truyền bệnh sốt rét chủ yếu ở huyện Nam Đông đang được Trung tâm Phòng chống Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng tiếp tục theo dõi, giám sát chặt chẽ nhằm tiên lượng được mức độ phục hồi lan truyền sốt rét để kịp thời đề xuất biện pháp xử lý, khống chế không để nguy cơ sốt rét quay trở lại hoặc nguy cơ xảy dịch, duy trì kết quả phòng chống sốt rét ổn định và bền vững; đảm bảo sức khỏe cho cộng đồng.