Ban chấp hành Đảng bộ Viện nhiệm kỳ 2015-2020 gồm 09 đồng chí như sau:.Đ/c Nguyễn Văn Chương, Bí thư Đảng bộ - Viện trưởng;.Đ/c Lê Thiện Phong, Phó bí thư Đảng bộ;.Đ/c Võ Trí Dũng, Ủy viên thường vụ, Chủ nhiệm UBKT Đảng;Đ/c Hồ văn Hoàng, Ủy viên Ban chấp hành; Đ/c Huỳnh Hồng Quang, Ủy viên Ban chấp hành;Đ/c Nguyễn Xuân Thiện, Ủy viên Ban chấp hành;Đ/c Hồ Đắc Thoàn, Ủy viên Ban chấp hành;.Đ/c Đào Ngọc Trung, Ủy viên Ban chấp hành;Đ/c Đào Trịnh Khánh Ly, Ủy viên Ban chấp hành

 Ban chấp hành Công đoàn cơ sở Viện nhiệm kỳ 2017-2022 gồm 09 ủy viên gồm các đồng chí: ThS.Hồ Đắc Thoàn- Đảng ủy viên, Trưởng phòng KHTH;ThS.Đào Ngọc Trung- Đảng ủy viên, Trưởng phòng TCCB;ThS.Bùi Văn Tuấn-Trưởng Khoa KST;BS CKII. Đào Trịnh Khánh Ly-Đảng ủy viên, P.Trưởng Khoa khám bệnh;ThS.Phạm Thị Trà-Trưởng phòng TCKT;TS.Nguyễn Xuân Quang, Trưởng Khoa Côn trùng;CN.Đinh Việt Hùng-Tổ trưởng Khoa Đào tạo;ThS. Phạm Thị Hòa, Phó Trưởng phòng HCQT;ThS.Nguyễn Doãn Khôi, Bí thư Đoàn TNCS HCM

Đoàn TNCS Hồ Chí Minh phát triển với sự đi lên của Viện được Đảng ủy, ban lãnh đạo quan tâm lãnh đạo và chỉ đạo. Với đặc thù công việc Đoàn Thanh niên luôn chú trọng tới việc giáo dục chính trị, tư tưởng, giáo dục y đức theo lời dạy của Bác “Lương y như từ mẫu” tuổi trẻ của viện luôn phấn đấu “Học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh”.

Ban Nữ công Viện Sốt rét KST - CT Quy Nhơn là tổ chức đoàn thể trực thuộc Ban chấp hành Công đoàn Viện Sốt rét KST-CT Qui Nhơn, dưới sự chỉ đạo của Đảng ủy Viện và Công đoàn nghành y tế Việt Nam. Trong thời gian qua phong trào thi đua "Giỏi việc nước -Đảm việc nhà" trong nữ cán bộ CNVC đơn vị luôn phát huy vai trò người phụ nữ gương mẫu trong công tác chuyên môn cũng như công tác xã hội & gia đình.