Tham mưu giúp Viện trưởng về công tác tổ chức, cán bộ và bảo vệ chính trị nội bộ; Triển khai thực hiện các chế độ chính sách đối với công chức, viên chức và nhân viên hợp đồng.Tham mưu giúp Viện trưởng thực hiện quản lý về cơ sở vật chất, thiết bị, công tác hành chính, văn thư, lưu trữ và lễ tân, khánh tiết.

NHÂN SỰ: Tổng số cán bộ: 11 viên chức. Trong đó:  Thạc sỹ: 05; Đại học: 05; Trung cấp: 01;Các tổ trực thuộc: Tổ PCR, Tổ Khảo nghiệm hóa chất-Thực phẩm.
CHỨC NĂNG VÀ NHIỆM VỤ CỦA PHÒNG:Ứng dụng sinh học phân tử chủ yếu là kỹ thuật PCR để phục vụ phòng chống sốt rét, các bệnh do ký sinh trùngvà côn trùng truyền.

Giám sát và chỉ đạo nâng cao chất lượng chấn đoán và điều trị bệnh sốt rét tại các tỉnh, khu vực miền Trung-Tây Nguyên. Tham gia trực tiếp công tác khám chữa bệnh tại phòng khám chuyên khoa ký sinh trùng của Viện.Giám sát thường quy ký sinh trùng sốt rét P. fanciparum và P. vivax kháng thuốc bằng kỹ thuật in vivo và in vitro.

- Quản lý xây dựng, sửa chữa cơ sở vật chất của cơ quan.Quản lý tài sản chung của cơ quan như cơ sở vật chất, tài sản cố định, điện nước, điện thoại… Theo dõi phát hiện hư hỏng và xuống cấp để kịp thời trình ban lãnh đạo Viện có kế hoạch mua sắm, sửa chữa, thay thế.

Nghiên cứu sự phân bố các bệnh giun sán ở 15 tỉnh trong khu vực miền Trung-Tây Nguyên.Nghiên cứu các yếu tố ảnh hưởng liên quan đến sự lưu hành bệnh giun sán.Nghiên cứu một số phác đồ điều trị các bệnh giun sán. Kết quả thu được sẽ phổ biến triển khai rộng rãi tại cộng đồng.

- Nghiên cứu chuyên sâu về muỗi Anopheles, muỗi sốt xuất huyết và các biện pháp phòng chống véc tơ truyền bệnh ở 15 tỉnh miền Trung-Tây Nguyên.Tham mưu cho lãnh đạo Viện về công tác côn trùng và biện pháp phòng chống bệnh do côn trùng truyền.Giám sát véc tơ truyền bệnh sốt rét, sốt xuất huyết và một số bệnh véc tơ truyền bệnh ở khu vực miền Trung-Tây Nguyên.

Phòng Quản lý khoa học công nghệ là phòng chức năng thuộc Viện, tham mưu giúp Viện trưởng trong công tác nghiên cứu khoa học, công nghệ thông tin và hợp tác quốc tế theo quy định của pháp luật.

Tổng số cán bộ: 24 cán bộ (Trong đó:01 Phó Giáo sư-Tiến sỹ Y học; 01 Thạc sỹ-Bác sỹ; 04 Bác sỹ; 03 Thạc sỹ, 04 Cử nhân và cán bộ khác). Các tổ trực thuộc: Tổ Chỉ đạo, tổ Giám sát,tổ Kiểm tra kỹ thuật, tổ Thống kê phân tích

Quản lý tài chính, kiểm tra giám sát các hoạt động kinh tế - tài chính, cung cấp thông tin qua việc ghi chép, phản ánh, tính toán quá trình hoạt động, thu, chi ngân sách của đơn vị.Lập dự toán thu, chi ngân sách nhà nước trong phạm vi được cấp thẩm quyền giao hàng năm.Tổ chức chấp hành dự toán thu, chi tài chính theo đúng quy định của Nhà nước.

Phòng Kế hoạch tổng hợp là phòng chức năng thuộc Viện, tham mưu giúp Viện trưởng trong công tác xây dựng kế hoạch hoạt động phát triển sự nghiệp y tế, công tác đấu thầu, mua sắm thuốc, hóa chất, trang thiết bị.

• Phòng Tổ chức cán bộ-Viện Sốt rét- KST-CT Quy Nhơn (28/02/2018)
• Phòng khám chữa bệnh chuyên ngành-Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn (28/12/2017)
• Trung tâm Dịch vụ khoa học kỹ thuật của Viện Sốt rét-Ký sinh trùng-Côn trùng Quy Nhơn (28/12/2017)