Tổ chức Y tế thế giới tại Việt Nam, nhiều năm nay đã đầu tư cho các chương trình dịch tễ sốt rét và các bệnh ký sinh trùng tại cả nước nói chung và khu vực miền Trung-Tây Nguyên nói riêng. Về dịch tễ sổt rét WHO đã tập trung đào tạo nguồn nhân lực:
Đào tạo hệ thống thông tin y tế (health mapper), đào tạo phương pháp giảng dạy cho cán bộ tuyến tỉnh (Training Methodology), đào tạo các giảng viên (TOT), đào tạo xét nghiệm viên các tuyến, đào tạo y tế thôn bản. Về ký sinh trùng WHO đã hỗ trợ chương trình phòng chống các bệnh giun truyền qua đất cho học sinh các trường tiểu học ở 9 tỉnh miền Trung (Quảng Bình, Quảng Trị-Thừa Thiên Huế, Đà Nẵng, Quảng Nam, Quảng Ngãi, Bình Định, Phú Yên và Bình Thuận); hỗ trợ chương trình phòng chống sán lá gan nhỏ cho 2 tỉnh Bình Định và Phú Yên, đặc biệt là WHO đã đưa Dự án loại trừ giun chỉ bạch huyết cho 4 huyện thuộc 2 tỉnh Khánh Hòa và Ninh Thuận.
Trong thời gian tới, WHO tiếp tục hợp tác với Viện đào tạo chương trình thống kê y tế, ứng dụng phần mềm Arcview và hỗ trợ đánh giá kết quả sau 2 năm ứng dụng phác đồ điều trị sốt rét mới của Bộ Y tế ban hành năm 2003. Tiếp tục hỗ trợ chương trình phòng chống các bệnh giun sán cho một số tỉnh thuộc khu vực miền Trung và Tây Nguyên.