Đất nước ta bước sang giai đoạn mới với nhiều cơ hội mới nhưng cũng phải đối mặt với không ít những khó khăn thách thức của nền kinh tế thời kỳ hội nhập do đó công tác quốc phòng-an ninh luôn được đặt lên hàng đầu.
Trong hướng dẫn về tăng cường sự lãnh đạo của Đảng đối với công tác quốc phòng-an ninh trong tình hình mới, Chỉ thị 12 CT/TW của Bộ Chính trị (Khóa X) đã yêu cầu các cơ quan, đơn vị trong bộ máy Nhà nước cần tổ chức quán triệt và triển khai công tác giáo dục quốc phòng-an ninh tạo sự chuyển biến mạnh mẽ về nhận thức, đề cao trách nhiệm, năng lực của các cấp ủy Đảng trong lãnh đạo, chỉ đạo tổ chức thực hiện công tác giáo dục quốc phòng-an ninh đáp ứng yêu cầu xây dựng và bảo vệ tổ quốc xã hội chủ nghĩa trong tình hình mới.
Bộ Y tế cũng đã có Công văn số 7513/BYT-KHTC ngày 12/10/2007 hướng dẫn các Sở Y tế các tỉnh/thành phố và các đơn vị trực thuộc Bộ tổ chức quán triệt và triển khai Chỉ thị 12 CT/TW của Bộ Chính trị; Cấp ủy, lãnh đạo các cơ quan đơn vị, Ban cán sự Đảng, đoàn có chủ trương đưa vào nghị quyết lãnh đạo xây dựng kế hoạch và hướng dẫn triển khai thực hiện công tác giáo dục quốc phòng, an ninh của cơ quan đơn vị mình. Phối hợp với các tổ chức xã hội, ban ngành, đoàn thể tổ chức tuyên truyền giáo dục đường lối, quan điểm về quốc phòng toàn dân, an ninh nhân dân của Đảng, Nhà nước; giáo dục lòng yêu nước, yêu chế độ xã hội chủ nghĩa, lòng tự hào, tự tôn dân tộc. Ban tổ chức cấp ủy các cấp chủ trì phối hợp với các cơ quan quân sự, công an địa phương rà soát cán bộ lãnh đạo, quản lý do cấp ủy quản lý chưa bồi dưỡng kiến thức quốc phòng, an ninh tại các trường quân sự quân khu, trường quân sự cấp tỉnh/huyện lập kế hoạch bồi dưỡng cho từng năm, bảo đảm nhiệm kỳ công tác đều được bồi dưỡng kiến thức quốc phòng-an ninh.
Thường xuyên kiện toàn Ban chỉ huy quân sự của đơn vị, rà soát, xây dựng, bổ sung kế hoạch phòng chống cháy nổ; kế hoạch phòng chống thiên tai, bão lũ…’ điều chỉnh các kế hoạch A, A2; kế hoạch B hoặc kế hoạch tác chiến bảo vệ cơ quan đơn vị đưa hoạt động đơn vị vào nề nếp. Xây dựng mô hình nhiệm vụ, tổ chức, biên chế trang bị cho các tổ tự vệ y tế chuyên ngành, các phân đội y tế cơ động; đội phẫu thuật cơ động, đội vệ sinh phòng dịch cơ động sẵn sàng đáp ứng các tình huống về y tế khi có yêu cầu.
Sở Y tế các tỉnh, thành phố tiến hành rà soát cán bộ nhân viên y tế trong khu vực quản lý, hoàn thiện mô hình nhiệm vụ, tổ chức, biên chế, trang bị cho các bệnh viện dã chiến dự bị động viên, đội điều trị dự bị động viên theo Quyết định 137/2005/QĐ-TTg ngày 9/6/2005 của Thủ tướng Chính phủ về việc giao chỉ tiêu kế hoạch Nhà nước về xây dựng và huy động lực lượng dự bị động viên tuyến tỉnh.
Bộ Y tế yêu cầu các cơ quan, đơn vị phải tổng hợp báo cáo kết quả thực hiện Chỉ thị 12/CT-TW hàng năm vào ngày 1/11 gửi về Vụ Kế hoạch-Tài chính Bộ Y tế tđể ổng hợp báo cáo Bộ Chính trị.