Đầu năm 2011, Bộ Y tế đã có quyết định thành lập Ban điều hành Trung ương phòng chống sốt xuất huyết thuộc Dự án phòng chống các bệnh lây nhiễm, chương trình mục tiêu quốc gia y tế năm 2011 thay cho quyết định trước đây, ngay sau đó Ban điều hành Trung ương đã họp tại Hà Nội để đánh giá công tác phòng chống sốt xuất huyết năm 2010 và bàn kế hoạch hoạt động năm 2011.
Quyết định số 627/QĐ-BYT ngày 4/3/2011 về việc thành lập Ban điều hành Trung ương phòng chống sốt xuất huyết năm 2011 có một số thay đổi so với trước đây (Quyết định số 1544/QĐ-BYT ngày 7/5/2010). Theo Quyết định này Ban Điều hành Trung ương phòng chống sốt xuất huyết có 27 thành viên do ông Nguyễn Văn Bình-Cục trưởng Cục Y tế dự phòng làm Trưởng ban; giúp việc cho Ban điều hành Trung ương còn có Tổ thư ký gồm 21 thành viên do ông Phạm Hùng-Chuyên viên Cục Y tế dự phòng làm Tổ trưởng. Các ủy viên của Ban điều hành và thành viên của Tổ thư ký bao gồm đại diện của Cục Y tế dự phòng, các Vụ/Cục chức năng thuộc Bộ Y tế, các Viện nghiên cứu thuộc hệ y tế dự phòng và các đơn vị tham gia thực hiện Dự án phòng chống sốt xuất huyết trong năm 2011. Đơn vị thường trực của Ban điều hành Trung ương phòng chống sốt xuất huyết đặt tại Cục Y tế dự phòng, Bộ Y tế; giúp việc cho Ban điều hành ngoài Tổ thư ký còn có các cán bộ, chuyên viên của Cục Y tế dự phòng, hoạt động theo sự chỉ đạo của Trưởng ban điều hành.
Ban điều hành chịu trách nhiệm trước Bộ trưởng Bộ Y tế và trước Chủ nhiệm chương trình mục tiêu quốc gia y tế năm 2011 về toàn bộ thành phần phòng chống sốt xuất huyết thuộc Dự án phòng chống các bệnh lây nhiễm, Chương trình mục tiêu quốc gia y tế năm 2011. Xây dựng kế hoạch hoạt động của thành phần phòng chống sốt xuất huyết trình cấp có thẩm quyền phê duyệt và tổ chức thực hiện kế hoạch sau khi được phê duyệt. Phối hợp với các Bộ, ngành, các tổ chức, đoàn thể xã hội tăng cường thực hiện công tác phòng chống sốt xuất huyết; theo dõi, giám sát, đánh giá việc thực hiện thành phần phòng chống sốt xuất huyết. Quản lý và sử dụng có hiệu quả các nguồn lực của thành phần phòng chống sốt xuất huyết đúng mục đích, đạt hiệu quả kinh tế và theo đúng các quy định hiện hành của nhà nước. Báo cáo kết quả thực hiện thành phần phòng chống sốt xuất huyết trình Lãnh đạo Bộ Y tế và các cơ quan liên quan theo quy định; tổ chức bàn giao tài liệu, tài chính, tài sản khi thành phần phòng chống sốt xuất huyết kết thúc theo quy định của Bộ Y tế.
Tại cuộc họp đầu tiên vào trung tuần tháng 3/2011, Ban điều hành Trung ương phòng chống sốt xuất huyết đã báo cáo tóm tắt đánh giá kết quả hoạt động năm 2010, kế hoạch hoạt động và phân bổ kinh phí năm 2011; đồng thời thống nhất danh sách tập thể, cá nhân có thành tích xuất sắc trong công tác phòng chống sốt xuất huyết năm 2010 đề nghị cấp trên khen thưởng.
Đánh giá công tác phòng chống sốt xuất huyết năm 2010, là năm thứ hai triển khai dự án kể từ khi được phê duyệt bổ sung trong Chương trình mục tiêu quốc gia phòng chống một số bệnh dịch nguy hiểm và HIV/AIDS; được sự quan tâm chỉ đạo sát sao của Bộ Y tế, Ban điều hành phòng chống sốt xuất huyết Trung ương và Ban điều hành các khu vực đã tập trung kiện toàn bộ máy tổ chức, chuẩn bị triển khai dự án và chỉ đạo hướng dẫn chuyên môn kỹ thật, dự trữ hóa chất, trang thiết bị cho công tác phòng chống sốt xuất huyết; kinh phí, vật tư, trang thiết bị, hóa chất của dự án đã được cung cấp đầy đủ, kịp thời và đúng tiến độ ngay từ đầu năm 2010.
Tuy nhiên, năm 2010 tình hình sốt xuất huyết diễn biến phức tạp không theo xu thế dịch sốt xuất huyết trên thế giới; cả nước ghi nhận 128.831 trường hợp mắc, 109 trường hợp tử vong; so với số ca mắc/chết năm 2009 (105.370/87) số mắc cả nước tăng 22%, số tử vong tăng 25.3%, dịch sốt xuất huyết xảy ra muộn vào tuần 39-40 của các tháng cuối năm. Đa số các tỉnh thuộc khu vực miền Trung và Tây Nguyêncó chỉ số BI và DI cao quá ngưỡng cho phép; khu vực miền Nam chỉ số côn trùng năm 2010 thấp hơn năm 2009 ở những tháng mùa khô, nhưng lại vượt năm 2009 vào mùa mưa, chỉ số lăng quăng tăng cao từ tháng 5, chỉ số muỗi tăng mạnh từ tháng 6; một số tỉnh miền Bắc (khu IV cũ) có chỉ số BI và DI vượt ngưỡng gây dịch. Việc phòng chống sốt xuất huyết chủ động như thực hiện các biện pháp diệt véc tơ truyền bệnh trước khi có dịch xảy ra, tiến hành phun hóa chất chủ động khi mật độ muỗi cao, xử lý triệt để ổ dịch sốt xuất huyết ngay từ các trường hợp mắc bệnh đầu tiên là có hiệu quả; bên cạnh đó để nâng cao hiệu quả phòng chống sốt xuất huyết còn cần có sự tích cực chủ động giám sát, thực hiện đúng kỹ thuật của các địa phương, đơn vị; một số xã dịch kéo dài 3-4 tháng là do chính quyền địa phương và cộng đồng chưa tham gia tích cực vào công tác phòng chống dịc; công tác phối hợp giữa giám sát, chẩn đoán và điều trị, chia sẻ thông tin còn hạn chế. Nhiều ổ dịch xử lý muộn, không thực hiện công tác diệt bọ gậy, vệ sinh môi trường trước khi xử lý bằng hóa chất; kỹ thuật phun chưa đúng kỹ thuật do cán bộ phun chưa được tập huấn đầy đủ và thiếu nhân lực; kinh phí cấp bổ sung cho chống dịch không kịp thời làm giảm hiệu quả của việc triển khai chống dịch sốt xuất huyết. Diễn biến thời tiết phức tạp, nhiệt độ tăng, mùa mưa đến sớm kéo dài trên diện rộng, tạo điều kiện cho muỗi truyền bệnh phát triển; muỗi truyền bệnh sốt xuất huyết kháng hóa chất tại một số địa phương làm ảnh hưởng đến hiệu quả của việc sử dụng hóa chất phòng chống sốt xuất huyết. Tốc độ đô thị hóa nhanh chóng, du lịch phát triển và thói quen tích trữ nước sinh hoạt tại một số vùng là nguyên nhân thuận lợi bùng phát dịch; ý thức của cộng đồng về phòng chống sốt xuất huyết còn thấp; các chiến dịch diệt bọ gậy, lăng quăng được tổ chức mang nặng tính hình thức, chưa hiệu quả và không duy trì được lâu dài. Vấn đề xã hội hóa công tác phòng chống sốt xuất huyết gặp rất nhiều khó khăn, một số địa phương, các cấp chính quyền chưa thực sự quyết liệt chỉ đạo công tác này; việc phối hợp giữa ngành y tế và các ban, ngành, đoàn thể của địa phương thiếu chặt chẽ.
Kế hoạch năm 2011, dự án phòng chống sốt xuất huyết tiếp tục được thực hiện nhằm đạt được các mục tiêu, chỉ tiêu của Thủ tướng Chính phủ giao; trước hết là giữ vững mục tiêu giảm mắc, giảm chết do sốt xuất huyết, Ban chỉ đạo các cấp cần tăng cường tổ chức, chỉ đạo giám sát dịch tễ, kiểm tra và đôn đốc thực hiện tới tận tuyến xã, phường; phát hiện sớm ca bệnh, xử lý kịp thời và ngăn chặn có hiệu quả đường lây truyền bệnh, chỉ đạo chiến dịch phun hóa chất, diệt bọ gậy, truyền thông có hiệu quả; ngoài việc theo dõi các chỉ số muỗi, bọ gậy/lăng quăng để đánh giá kết quả xử lý ổ dịch, cần theo dõi bệnh nhân đảm bảo sau 14 ngày kể từ khi xử lý ổ dịch không có bệnh nhân mắc mới ở xã/phường xảy ra ổ dịch. Củng cố và mở rộng mô hình phòng chống sốt xuất huyết chủ động dựa vào cộng đồng (cộng tác viên, trường học, học sinh, hội phụ nữ), tăng cường sự phối hợp của các cấp chính quyền nâng cao ý thức cộng đồng trong việc xã hội hóa công tác phòng chống sốt xuất huyết; củng cố Ban điều hành Trung ương, khu vực, có phân công trách nhiệm cụ thể đối với từng thành viên trong việc thực hiện mục tiêu, chỉ tiêu đề ra; cần linh hoạt trong triển khai kế hoạch đảm bảo tính phù hợp của các chiến dịch xử lý ổ dịch, giám sát chủ động để phù hợp diễn biến tình hình dịch. Củng cố công tác giám sát, điều trị ca bệnh nhằm hạn chế nguồn lây truyền; củng cố và phát triển đội ngũ cán bộ côn trùng phục vụ công tác giám sát dịch và đánh giá hiệu quả dập dịch có tầm quan trọng đặc biệt; đồng thời với tập trung nghiên cứu các vấn đề liên quan đến vai trò véc tơ truyền bệnh, tính kháng hóa chất, thí điểm các mô hình, kỹ thuật mới trong phòng chống sốt xuất huyết.