Quỹ Toàn cầu (Global Fund) thành lập năm 2002, tính đến nay, quỹ đã trở thành nguồn tài chính quốc tế cung cấp 3/4 kinh phí cho các hoạt động phòng chống sốt rét toàn cầu. Riêng đối với công tác phòng chống sốt rét ở Việt Nam, Dự án Quỹ Toàn cầu Phòng chống sốt rét (VGFMalaria) đã thực hiện vòng 3 từ năm 2005 đến năm 2008 cho 23 tỉnh trọng điểm sốt rét và vòng 7 tiếp tục từ năm 2009 đến năm 2013 cho 29 tỉnh, trong đó có 23 tỉnh cũ của vòng 3 và triển khai mở rộng thêm cho 6 tỉnh mới.
Qua thời gian phối hợp thực hiện, theo thống kê báo cáo cho thấy số bệnh nhân sốt rét giảm 59,9%, ký sinh trùng sốt rét giảm 29,5%, người tử vong do sốt rét giảm 38,1%; năng lực chuyên môn của cán bộ y tế ở các tuyến trong hoạt động phòng chống sốt rét được nâng cao, trang thiết bị, vật tư, thuốc sốt rét và phương tiện đi lại cũng được dự án hỗ trợ đầy đủ, giúp các tuyến hoạt động tốt.
Ngoài ra, hàng loạt các hoạt động truyền thông giáo dục sức khỏe phòng chống sốt rét được thực hiện thường xuyên bằng nhiều hình thức đã nâng cao kiến thức của người dân về bệnh sốt rét, các biện pháp phòng bệnh cũng như thực hành những biện pháp này được thực hiện tốt hơn, góp phần đáng kể trong việc duy trì những kết quả đã đạt được và tính bền vững của Chương trình mục tiêu Quốc gia Phòng chống sốt rét ở Việt Nam.