Theo chỉ tiêu đào tạo Trung cấp chuyên nghiệp hệ chính quy của Bộ Y tế và Bộ giáo dục & Đào tạo năm 2007, Viện Sốt rét-KST-CT Quy Nhơn đã tố chức xét tuyển và gọi nhập học 80 học sinh lớp Kỹ thuật viên xét nghiệm Trung học Khóa 30 (2007-2009) bao gồm 23 nam (28,75%) và 57 nữ (71,25%) đến từ 16 tỉnh thuộc khu vực miền Trung-Tây Nguyên và một số tỉnh/thành trong cả nước. Ngày 8/10/2007, Viện đã tổ chức Lễ khai giảng lớp Kỹ thuật viên xét nghiệm Trung học Khóa 30 với sự tham dự của Đảng ủy, Ban Giám đốc, Trưởng các Khoa/Phòng, các giảng viên, hướng dẫn viên cùng toàn thể học viên các khóa đang đào tạo tại Viện.

Được phép của Bộ Y Tế, Bộ Giáo dục & Đào tạo; từ 2005 Viện Sốt rét-KST-CT Quy Nhơn đã chính thứcđào tạo Kỹ thuật viên xét nghiệm trung học hệ Vừa làm vừa học. Đối tượng đào tạo là các Xét nghiệm viên sơ học có bằng tốt nghiệp phổ thông trung học đang công tác tại các cơ sở y tế từ hai năm trở lên.

 Thực hiện chỉ tiêu đào tạo được Bộ Y tế và Bộ Giáo dục-Đào tạo giao, Lớp Kỹ thuật viên trung học khoá I hệ vừa làm vừa học năm học 2006-2007 của Trường Viện Sốt rét-KST-CT Quy Nhơn đã hoàn thành chương trình đào tạo tại trường, trong đó có chương trình thực tế tốt nghiệp phục vụ mục tiêu phòng chống sốt rét.

Đào tạo lại: 99 khóa đào tạo lại cho 3.133 học viên các tuyến